南京大学矿业工程学科是南京大学重点建设的一级学科，已连续两次入选国家“双一流”建设学科。该学科拥有一级学科博士学位授权点，并与地质学、地质资源与地质工程、地理学等相关学科联合支撑，致力于发展具有南大特色的研究方向。学科重点发展矿山工程监测技术、非金属及关键金属矿物的加工技术以及矿山资源勘探的新技术。此外，积极推进矿山工程3S技术、矿山地质灾害监测与预警技术、绿色矿山技术以及碳中和技术等领域的研究，已形成了包括分布式光纤监测技术在内的一系列具有国际先进水平的新成果。
在QS公布的2017、2018和2019年矿产和采矿工程专业世界排名之中，南京大学分别位居全球第42、43、25位。2017年，第一轮双一流建设高校名单公布，其中矿业工程入选双一流学科建设的高校有6所，分别为南京大学、中南大学、中国矿业大学、北京科技大学、中国矿业大学（北京）、武汉大学。2022年，第二轮双一流建设高校名单公布，其中矿业工程入选双一流学科建设的高校有5所，分别为南京大学、中南大学、中国矿业大学、北京科技大学、中国矿业大学（北京）。
2023年，南京大学新增“矿业工程”一级学科博士招生专业，下设5个研究方向：矿物加工与资源高效利用、矿山灾害安全防治、采矿工程地质、绿色矿山环境、矿山智能探测技术。具体信息见《南京大学2023年博士研究生招生章程及招生目录》。